Lielākā daļa rāpuļu elpo, kā cilvēki dara: viņi ieelpot skābekli caur nāsīm vai muti. Tomēr ūdens bruņurupuči un dažas čūskas arī var iegūt nelielu daudzumu skābekļa no ūdens. Kaut arī čūskas parasti virsmas, lai papildinātu skābekļa krājumus, tās var absorbēt skābekli no ūdens caur ādu. Bruņurupuči ekstrahē skābekli no ūdens caur ādu uz kakla un kloākas - kamerā, caur kuru iziet ekskrementi, urāti un olas.
Temperatūras atkarīgais droseļvārsts
Lielākā daļa rāpuļu ir ekotermiski dzīvnieki, kas nozīmē, ka viņu bioloģiskie procesi notiek ātrāk, kad dzīvnieki ir silti un lēnāk, kad dzīvnieki ir vēsi. Tas nozīmē, ka jo augstāka temperatūra, jo vairāk ir nepieciešams skābekļa rāpuļi. Tādēļ aukstās temperatūrās, piemēram, ziemas ziemas guļas laikā, dažas čūskas un bruņurupucis var iegūt pietiekami daudz skābekļa no ūdens, lai apmierinātu savas vajadzības, nepieļaujot gaisa virsmu.
