Suņu kroplības izraisītas vakcinācijas dažreiz var izraisīt mainīgas blakusparādības. Ne visi suņi piedzīvos nevēlamās blakusparādības svarīgām inokulācijām, bet daudziem cilvēkiem būs blakusparādības attiecībā uz viņu izjūtu un uzvedību. Dažas no tām ir vieglas un mazas bažas, bet, ja ilgstoša lieta, tas var liecināt par nopietnāku problēmu. Citiem, kas ir smagāki, nepieciešama tūlītēja veterinārā uzmanība. Dzīvnieku īpašniekiem ir svarīgi apzināties, ka suņi saskaras ar neskaidrām vakcinācijām.
Kaut arī blakusparādības ir retāk sastopamas, suns mikroshēmu var dažreiz izraisīt dažādus efektus, piemēram, īslaicīgu asiņošanu, matu izkrišanu, infekciju, abscesus un mikročipu migrāciju.